Có 3 loại nguyên nhân chính gây ung thư gan nguyên phát:
- Viêm gan B mạn tính
- Viêm gan C mạn tính
- Bệnh gan gây ra bởi uống quá nhiều đồ uống có cồn
Các nguyên nhân khác ít phổ biến hơn, và có thể bao gồm các bệnh di truyền về gan, xơ gan (sẹo ở gan), hoặc một chất độc có tên aflatoxin được tìm thấy trong đậu phộng, lúa mì, đậu nành và ngũ cốc mốc.